Накануне 50-летия Октябрьской революции, 14 мая 1966 года, в Змиевской средней общеобразовательной школе № 1 был создан Музей Боевой славы (приказ Министерства образования УССР № 39).
27 августа 1996 года Музей был перерегистрирован как историко-краеведческий музей Змиевской общеобразовательной средней школы № 1 (регистрационный № 498). Очередная перерегистрация музейного учреждения состоялась 20 ноября 2001 года.
8 ноября 2011 года, в связи со 140-летием учебного заведения (которое в это время уже называлось Змиевской лицей № 1 имени дважды Героя Советского Союза З. К. Слюсаренко), историко-краеведческий музей был реорганизован в музейный комплекс Змиевского лицея № 1 имени З. К. Слюсаренко и получил современную структуру.