Где проходить подготовительные курсы?

Подготовительные курсы — абсолютно добровольное дело. Пройти Вы их можете в любом вузе.
Но вот баллы за них (и прочие привилегии, например, скидки в оплате и т.п.) будут действительны лишь при поступлении в тот же самый вуз, при котором курсы.

Мне интересно, обязательно ли проходить их при ВУЗе, или можно их пойти в любом удобном для меня цетре подготовке...

Ну, тут, как я и описал: если Вас интересует сам материал, который там преподаётс, можете проходить, где Вам удобно. Если же нужны доп. баллы (если они будут в 2014 году), то нужно именно в вузе.

А ВУЗы могут ли принимать аттестаты курсов из тех что я проходила? Будут они надавать дополнительные баллы?

В общем это так: порядок и условия начисления дополнительных баллов будут опубликованы в правилах приёма конкретного вуза (из того, что разрешают "общие" Условия приёма). Там и будет указано, какие курсы и при каких условиях будут приниматься.

Спасибо.